Наряду с обновлением храма неподалёку велось строительство военного госпиталя (действует по сей день).
До 1896 года в церкви не было прихода, но уже в следующем году храм насчитывал почти 200 прихожан мужского пола. В 1898 году в здании на средства зажиточных и обычных прихожан, а также при непосредственном участии известного смоленского купца-мецената П.А. Будникова был произведён капитальный ремонт. До 1929 года в храме богослужения не прекращались, потом он был закрыт.
Годы войны принесли городу и культовым сооружениям многочисленные повреждения и разрушения. И Верхне-Георгиевская церковь не избежала этой участи. Отремонтированный и немного изменённый храм после войны использовался в качестве склада. В конце XX века постройка существенно разрушилась, остались только стены. Переданный в ведение епархии, храм постепенно восстановили (участвовали и горожане, и предприятия), вернули ему былой вид и установили новый иконостас. Освящение проводил тогда ещё митрополит Смоленский и Калининградский Кирилл — ныне глава РПЦ. С 1998 года в церкви проводятся регулярные богослужения, есть воскресная школа.